마이크로시스틴은 녹조 원인 조류인 남조류에서 생성되며 인체에 간독성을 유발하는 유해물질이다. 우리나라에서는 독성이 가장 강한 마이크로시스틴-LR에 대해 1㎍/L(10억분의 1) 이하가 되도록 먹는 물 수질감시항목으로 지정하고 있다.
이 검사는 충북보건환경연구원 먹는물검사과에서 청주시민이 사용하는 수돗물의 취수원인 대청호에서 해마다 녹조현상이 발생되고 있어 조류독소의 위해성이 제기된 이후, 분석을 통한 결과를 시민들에게 제공하기 위해 지속적으로 실시하고 있다.
충북보건환경연구원에서는 2013년부터 액체크로마토그래피 질량분석기를 도입하여 녹조 생성기에서 소멸기까지 지속적으로 마이크로시스틴-LR을 분석해 모니터링 하고 있다.
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